
2024年9月由东莞种植业大专张万刚先生团队协作在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生物制品为该研究提供了亚硝基化装饰组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
中文版标题格式:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
杂志期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry
202历经四年关系细胞:5.7
投稿时长:2024年9月
用户机构:南京农业大学
深入分析素材:蛋白
拜谱出示技木:亚硝基化修饰组学
技术设备自驾路线:
一、科学研究结杲
01.Caspase-3活力
现如今尚不很明白NO对caspase-3的缓和用是否需要归因于NO介导的S-亚硝基化,不相同质量浓度梯度方向的GSNO用于外源性NO提供,以分析caspase-3的离体S-亚硝基化。结局证实,与是没有GSNO的组想必,100、200和400μM GSNO组的caspase-3吸附性酶类为显著削减(图1),与原先了解不符。GSNO加工削减caspase-3吸附性酶类的潜在性的主要原因仍亟待展现。
图1 不一浓度值的GSNO净化处理对caspase-3灵活性的危害
02.Caspase-3的S-亚硝基化状态
设计Caspase-3的亚硝基化层面,以指出GSNO对Caspase-3的化学反应性。经GSNO加工处理后,加测到caspase-3血清S-亚硝基化抗拉强度不断增加(图2)。某些最终得出结论,外源性GSNO养育可好成脂caspase-3的身体S-亚硝基化。真令人咋舌的是,在都没有GSNO会存在的比对组中加测到有一个变弱的S-亚硝基化带,这得出结论caspase-3会遭受内源性的S-亚硝基化。除此之外,本设计中caspase-3的S-亚硝基化层面较高,而caspase-3的化学活化减少,这与前几天的设计完全一致。然后,caspase-3的特男人S-亚硝基化装饰位点尚不模糊不清,还需加强组织领导骤的挑战。
图2 GSNO加工处理对caspase-3S-亚硝基化情况的直接影响
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化体现组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的字段。颜色标识的字段标识S-亚硝基化肽,大红色标识的C标识S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱仪
04.S-亚硝基化Caspase-3吸附结蛋白质
结淀粉酶质酶做为这种决定性的生殖内部骨架淀粉酶质酶,在能维持肌生殖内部形式的形式完正性和收缩毛孔性上起着决定性效应,研发S-亚硝基化caspase-3对结淀粉酶质酶分解的敏感脆弱性具决定性价值。与Std(未用胱天淀粉酶质酶酶-3和GSNO孵育的刚开始肌植物氯纶淀粉酶质酶)组不同之处,0 μM GSNO组(肌原植物氯纶和caspase-3的孵育,无GSNO)的完正结淀粉酶质酶含铁差异性消减,温馨提示caspase-3对结淀粉酶质酶具因素的淀粉酶质酶球蛋白质酶质水解专业能力。在GSNO孵育后,完正结淀粉酶质酶的含铁非常明显增高(P < 0.05)。除外,当GSNO氨水浓度上升时,完正结淀粉酶质酶的含铁定期上涨(P < 0.05)(图5)。一项出现说明,SNO呈现的caspase-3以技术依赖感的手段限制结淀粉酶质酶的分解。
图5.S-亚硝基化caspase-3溶解结球蛋白
05.S-亚硝基化Caspase- 3降解塑料肌钙血清-T
肌钙核淀粉酶-T (TnT)是原肌球核淀粉酶控制责任背部肌肉抽缩的细条的需要肌原化学棉纤维材料核淀粉酶。TnT的化学可分解的特点是测量到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化必备条件下,caspase-3对TnT的化学可分解条件如同6一样,与Std组(包括caspase-3和GSNO的肌原化学棉纤维材料)想必,caspase-3组中30 kDa TnT段落明星增强,显示caspase-3参加了TnT的化学可分解,于此,caspase-3与GSNO的孵育以至于30 kDa TnT下滑。在100和200 μM GSNO组内不存在测量到明星的异同(P > 0.05),而当GSNO的溶度符合400 μM 时,该段落明星限制(P < 0.05)。此类发现显示了SNO突显的caspase-3对TnT化学可分解的促使效用。结核淀粉酶和TnT是caspase-3的神经敏感底物,而GSNO处置拉低caspase-3的渗透性将以至于肌原化学棉纤维材料核淀粉酶化学可分解程度较拉低。总而言之所说,NO成脂的S-亚硝基化能够经过突显半胱氨酸残基来控制caspase-3的渗透性,而使进一次后果其对结核淀粉酶和TnT的核淀粉酶电离本事,然后后果鸡肉品质保证。
图6. S-亚硝基化caspase- 3光降解肌钙蛋白质-T
二、总结ppt
本学习有赖于浅谈S-亚硝基化对caspase-3绘制的决定和随着对鸡肉肌原玻纤身体之外可降解的决定。血清酶酶S-亚硝基化能能绘制caspase-3的半胱氨酸残基,而会导致caspase-3灵活性拉低,进一大步抑止了其对鸡肉肌原玻纤血清酶酶的血清酶酶油脂水解性能。三、拜谱总结
论述所采用了酶活法测,亚硝基化体现组学定量分析,WB等检查测量技术,发现了球血清S-亚硝基化可不可以体现caspase-3的半胱氨酸残基,这造成 了caspase-3活性酶类的减轻,齐头并进一个步骤阻止了其对羊肉肌原纤维素球血清的球血清油脂水解力量。本论述为定义球血清质亚硝基化对吃起来的房产调控机制化保证了一大个新的视野。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的蛋清质组学、修饰语蛋清质组学、代谢转化组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸系列成品成品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺过酸、total被氧化恢复备份、解离巯基,欢迎大家咨询!
参考资料医学文献:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663