代谢组学技术在中药研究中的应用主要体现在以下几个方面：
1. 中药成分分析与质量控制
基本电学物质签定：消化吸收组学高技术性工艺要对中药配方茶中的耐腐蚀基本电学物质实行全面性分折，签定出中药配方材中的几丁质酶基本电学物质。譬如，利于对于质谱（MS）的消化吸收组学高技术性工艺，需要签定出红参中的红参皂苷等几丁质酶基本电学物质。这些高技术性工艺还需要界定中药配方和非中药配方那部分的耐腐蚀符号物，为中药配方茶的的品质管理供给前提。
重量抑制：凭借分泌组学技术性，是都能能对中成药茶的重量参与监测和抑制。举列，使用蕨类树木分泌组学讲解，是都能能建设重视类痛风性肘骨关节炎的中成药茶组成的重量标出的化学式发光法步骤。不但，分泌组学还是都能能快速精确中成药茶中的致癌性组成举例致癌性制度，如凭借UPLC-Q-TOF-MS深入分析，分别不一样乌头蕨类树木的化学式组成，并快速精确更具镇痛药灵活性和急性膀胱致癌性的生态学碱。
2. 中药药效机制研究
角色靶点辨识：细胞代谢组学科技可以让辨识中药配方活力成分表的氧分子靶点。随后，论述发掘雷公藤红素可完成调Treg/TH1和Treg/Th17动平衡、阻挡NF-κB通道等体系激发抗感染角色。
意义共识新系统诠释：消化吸收组学工艺并能阐述中要配方医治传染性疾病的意义共识新系统。如，深入介绍感觉青蒿素抗药与疟原虫的线粒体消化吸收改善相关内容，非靶点消化吸收组学阐述了与该具体步骤相关内容的消化吸收物发生变化无常。与此同时，消化吸收组学还能否用介绍消化吸收物的发生变化无常，深入介绍中要配方复方的意义共识新系统。
3. 中药安全性评价
渗透性原则探讨：分解产生组学技术性也可以用来探讨草药的渗透性原则。譬如，利用分解产生组学和16S rDNA测序的整和探讨，阐述了清益汤对病情比较重的时候突然胰腺炎相关联突然肺受损的保护措施原则，并判断了铁沉着冷静、相互影响分解产生物制品和微生物菌种制品菌群区间内的的关联。
健康管理性考核：分解组学技術还就能够用做成药的健康管理性考核，识别系统隐性的致癌性成份和致癌性靶点，关键在于为成药的健康管理使用的给予完美意义。
4. 中医证候研究
证候涉及到分泌物剖析：分泌组学技艺不错使用在探讨方法与医学证候涉及到的内源性分泌物不同，引导医学证候的临床诊断和调查。举例，在分泌组学探讨，已在冠心脏病的人中评定出与痰瘀证和和气气阴两虚证涉及到的生物工程标志图案物。
证候行为矫正探究：消化吸收组学水平还行中用探究中葯对中医师证候的行为矫正效用。举例说明，依据消化吸收组学水平及聚类研究分析法研究分析法，看见“黄芪-茯苓-泽泻”等连接性食用的药物配搭适中用肾病网络综合评估症的新组方性食用的药物，也可以对三种肾病网络综合评估症相应的怪物标志图案物有关系。
5. 多组学技术整合应用
两组学组合资源：消化吸收组学与另外的组学新技术（如DNA组学、转录组学、球高蛋白组学等）的组合资源适用，为中医研究方案可以提拱一个多个多基本要素的了解框架图。这样的组合资源适用并不是加重了自己对中医成份在碳原子体系上对体内女性生理和病理学模式的直接影响，同时为阐释中医的反应原则和药用价值类物质基本条件可以提拱了强有效的用具。
病毒症状疗法长效规则：多个学水平应该用在深入分析中药材疗法病毒症状的分子式长效规则。举例说明，在血清质组学和分解组学的联和用，体现了与中医医生类型的膝环节骨性环节炎广泛相应的的差别的形容血清和分解通道。
基础代谢组学技术用在草药茶科研中的用，为草药茶的当代化和精准定位医学出示了首要的科学的鼓励，能助确保草药茶的规范规范化和时代高端化成长 。