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Microb Cell Fact | 遵义医科大学冯昆团队揭示无柄灵芝培养物产生灵芝酸的机制

发布时间：2024-07-25

三萜类化合物已表明出多的生物制品几丁质酶，也包括抗良性肿瘤和抗病力毒效用。常，三萜是顺利通过甲羟戊酸方式生成的，并从纯天然沉水植物和真菌孢子中导入。遵义医科大学冯昆团队在Microb Cell Fact（IF=6.4）上发表过了名为“Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile”的钻研本文。该钻研发现三萜类类化合物野生野生灵芝酸（GA）是能够夜体陪养的无柄野生野生灵芝菌丝体中二萜15,16-二氢丹参酮I（DHT）的怪物工程转化率引发的。依据转录组和球膳食纤维组学技能进步探秘无柄虫草粉菌丝体中DHT引发有两种虫草粉酸（GA）的共识机制，并结合两组学技能检验到的差别化dna和差别化球蛋清，得出DHT 怪物工程聚合 GA 的路经。拜谱生物提供了转录组测序和TMT定量蛋白质组学技术，为研究二萜生物转化为三萜提供了丰富的组学信息和候选基因。

文章名称：Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile（Microb Cell Fact，IF=6.4，2023.7）

客户单位：遵义医科大学

研究材料：无柄灵芝真菌菌丝体

拜谱提供技术：转录组测序、TMT定量蛋白质组学

研究结果

1.转录成分析和作用分级

可以通过对无柄野生灵芝真菌感染菌丝体开始转录组测序共获得67230个转录本和14297个单遗传dna。在他们单遗传dna中，492被签别为之间的关系表现遗传dna（DEGs），至少213个表现上涨，279个表现下降（图1A）。GO聚集讲解后，DEGs为生物制品工作（BP）、血上皮细胞组分（CC）和分子式能力（MF）3类。在BP类中，展现了前三子类：消炎药拆解产生工作，醋酸钠盐产生工作和甲酸盐产生工作;而在CC类中，血上皮细胞外区、突触软型体、突触形式是前三亚类。相对 MF类，甲酸脱氢酶（NAD）活力、硫化抹除酶活力和酸氨（或酰胺）对接酶活力是前三亚类（图1B）。在DEGs的KEGG径路讲解中，前30条聚集度上限的径路中含27条应属于产生，至少丁烷产生、乙醛酸盐和二羧酸盐产生、丙酸盐产生的信号径路可观聚集（图1D）。

图1|转录酚类化合物析和功能模块分为

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

2. 蛋白质组定量分析和功能分类

在对无柄虫草白色念珠菌菌丝体用血清质组学探讨，一共决定了16,457种独有肽、2606种血清质和2588种化学发光法血清质。在域值|FC|>1.2和p<0.05的淘汰前提条件下，在这些2606种血清质中，94种被鉴定会为不同之处展现出来血清（DEPs），之中52种上涨，42种下跌（图2A），图2C表明了不同之处展现出来血清的聚类解析法探讨热图。从GO探讨看，BP专业类别表明，几乎数DEPs参与进来冰醋酸盐拆分分解成操作工作、抗菌药拆分拆分分解成操作工作和食用的药物拆分拆分分解成操作工作。CC类DEPs在体神经受损组织细胞外区、过被被氧化物质酶体和微体中占比最快的人，被被氧化回归酶抗逆性和甲酸脱氢酶（NAD）抗逆性在MF类中DEPs的占比最快的人（图2B）。与转录组然而差不多，KEGG环路探讨表明，多数DEPs在拆分分解成中丰度，之中3条最丰度的行业是光合生物学体中的碳固确定置、碳拆分分解成和MAPK4g信号环路（图2D）。还有就是，在探讨GO统计资料库的CC对DEPs用亚体神经受损组织细胞确定探讨和标注（图2E），DEPs重要规划在体神经受损组织细胞质（40.66%）、体神经受损组织细胞结构（17.58%）、线粒体（12.09%）和内质网（8.79%），的理论上是GAs生物学体提炼的重要具体位置。

图2|血清质组的降钙素原检测进行分析和系统验证通过

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

3.转录组和蛋白质组数据相关性分析，RT-qPCR验证

为业物转为和比组备选DEGs和DEPs开发了维恩图，有20个性别差异呈现染色体组遗传（图3A）。对转录组和核蛋清酶质含量组中E组和C组一共有的DEGs/DEPs实施聚类算法分折，表明mRNA和核蛋清酶质含量相互有13个上浮染色体组遗传和3个调整染色体组遗传，DEGs前者翻译专业的DEPs呈现水准呈正关于，依据Pearson的关于指数公式分折，在转录组和核蛋清酶质含量组相互查重到相比较较高的关于性（R = 0.87）（图3C）。实时荧光定量PCR（RT-qPCR）探测没想到提示，E组和C组16个DEGs的传达能力一定的差异正相关，里面9个为调涨DEGs，4个为变动DEGs（图3D）。DEGs在RT-qPCR中的传达走势与转录多组分析没想到保持一致。

图3|蛋白质组的定量剖析剖析和特点手机验证

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

拜谱小结

综上所述，该研究结果为真菌对天然产物的生物转化提供了新的见解，这将有助于开发更有效、更经济的方法，以方便的方式获得稀有的三萜。拜谱生物提供了转录组测序、TMT定量蛋白质组学转录组学技术，拜谱生物可提供完善成熟的转录组学、蛋白组学、代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系。此外，拜谱生物推出的中药代谢组整体解决方案，基于更丰富、更专业的中药数据库，更高的数据质量、更优质的服务，可进行中药成分分析、中药入血/组织分析、网络药理学等分析，助力客户探索中药前言研究，欢迎致电咨询！

参考文献：Wang X, Wu H, Wong KH, Wang Y, Chen B, Feng K. Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile. Microb Cell Fact. 2023 Jul 28;22(1):139. doi: 10.1186/s12934-023-02156-5.

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