
拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用绘制淀粉酶组学产品,实现1000+高妙度淡化位点检测,稳定的初现径典靶点,全八卦方位生信具体分析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“遇到”到“查验”全方法安全服务,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。
PART 1
01、研究方法
02、实际统计数据
03、经“点”再现
在测试数据信息数据信息中,检测出很多医学文献中新闻稿件的精品靶点及衣康酸绘制位点,如第一点个被显示的衣康酸共价绘制淀粉酶KEAP1,各种糖酵解通道中的3个重中之重酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,各种炎性小体形成淀粉酶NLRP3和肿瘤细胞病变期间中的重中之重淀粉酶RIPK3等,其质谱图以下的图右图。
04、產品性能
1.很多质控
行业化活性聊天论文查重器孵育、SDS-PAGE论文查重、WB查验、样本量各种相关系数研究分析等供需双定位论文查重,抓好内容结论是真的吗性。2.高机械性能质谱检测设备APP
在Orbitrap Astral全新一带高鉴别质谱仪六道金刚咒下,确保衣康硝化作用淡化位点及蛋清签别新深层,肋力完美探究新出现。3.全具体流程一坐式服務
来源于拜谱菌物建立完善的研究渠道,可提供了“肿瘤细胞培养出来→电极孵育→WB查测→玄之又玄度衣康酸性反应装饰查测→专属密码生信研究→既定位点PRM确认”全步骤贴心服务,省时皮实更皮实。05、分享知识(一部分)
06、运用的方向
PART 2、医学文献分享视频
参考文献一
英文字母主题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)
汉语宝贝标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析
研究探讨信息:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。
(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)
学术论文二
英语翻译大标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)
中文翻译一级标题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性
探讨网站内容:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。
(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)
PART 3、范例研究想法
蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13含有较少的底物构建效果,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。
S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。
(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)
值得一提的是,在拜谱生物工程衣康硝化作用修饰语组评测动态数据中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康过酸呈现(以下几点图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。
PART 4、拜谱总结ppt
有所作为TCA循环往复中的在期间新陈分泌物,衣康酸转换新陈分泌、抗体抗体和真菌感染期间的相互之间用处,为手术实现治疗抗体抗体真菌感染性慢性病出示了代替手术实现治疗战略。衣康酸结构的类型中的亲电性α,β-不饱和状态羧酸结构的类型能对球蛋白酶质含量上的化学活化半胱氨酸残基实现烷基化装饰(迈克尔暴伤现象),相应译员后装饰被又名“衣康酸装饰(itaconation)”,于是不良影响球蛋白酶质含量实用功能,改善抗体抗体回话和新陈分泌经过,为多个慢性病抗癫痫药物生产研发出示新一个构想。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸绘制蛋白质组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医学检验可以说酶联免疫法靶点新陈代谢组(QMT1000)或精力消化吸收靶向治疗消化吸收组食品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!
学习医学文献
1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.